2019年11月30日 星期六

CRISPR-Cas9 基因治療(上)-- 遺傳性血液疾病

CRISPR-Cas9 是由美國 Berkeley 大學的 Dr. Doudna 和德國 MPUSP 的 Dr. Charpentier 合作研發的,兩位並於 2020 年得到諾貝爾化學獎。2023 年年底,美國 FDA 核准了用於兩個鐮刀型紅血球疾病(sickle cell disease, SCD)的基因治療:Vertex Pharmaceuticals 和 CRISPR Therapeutics 合作的 Casgevy (exagamglogene autotemcel, exa-cel) 和 Bluebird Bio 的 Lyfgenia (lovotibeglogene autotemcel, lovo-cel)。而後於 2024 年一月,FDA 也核准 Casgevy 用於治療乙型地中海貧血(transfusion-dependent β thalassemia, TBT)。

乙型地中海貧血(TBT)的成因


這兩種病是因為血紅蛋白基因突變而造成的,血紅蛋白(hemoglobin, Hb) 是由四個蛋白組成的:兩個 α-globin (HbA) 和兩個 β-globin (HbB)。TBT 是因為 HbB 突變而造成的,致病的突變有很多種,常見的突變是 β0/IVS-I-110 (G→A)(上圖紅色箭頭),是一個在 intron 裡的突變,這個突變會使 mRNA splicing 不正常(splicing mutation),無法轉譯成 HBB。如果突變是造成不正常 mRNA,無法轉譯成 HBB,導致無法組成血紅蛋白,紅血球無法運送氧氣,為 β0-thalassemia (thalassemia major)。如果突變是減少 HBB ,則是較輕微的 β+ thalassemia (thalassemia minor),這種情形是還是可以生產血紅蛋白,但是量比正常人少,但需要長期接受輸血。

註:IVS = intervening sequences,IVS1 表示在第一個 intron 裡面。


Figure / β globin gene and mRNA. (G Breveglieri et al, Biomed Res Int. 2015; doi: 10.1155/2015/687635)

鐮刀型紅血球疾病(SCD)的成因


SCD 也是因為 HBB 突變造成,最常見的突變是 HbS,第六個氨基酸的 glutamic acid 突變成 valine (GAG → GTG):βE6V。這個突變會使血紅蛋白黏在一起,結塊在一起,如果兩個 HBB 基因都帶有這種突變的話,結塊的程度會讓紅血球變成鐮刀的形狀。


Figure / HBB IVS-I-110 (G→A) mutation (G Feriotto et al, Lab Inves 2004; doi: doi.org/10.1038/labinvest.3700106)

2013 年的時候,Boston Children's Hospital 和 Dana-Farber Cancer Institute 的研究團隊發現 BCL11A 控制著 HbF (fetal Hb) 的表現。HbF 是胚胎時期的血紅蛋白,和成人的 Hb 不同的地方在於它是由兩個 α-globin 和兩個 γ-globin 組成,γ-globin 則和 β-globin 相似,嬰兒出生後,血紅蛋白的 γ-globin 會被 β-globin 取代,不過有極少數人一生都會不停的生產 HbF,被稱為 hereditary persistence of fetal hemoglobin (HPFH)。有 HPFH 的人基本上都很健康,但是極少數有 HPFH 的 SCD 患者,他們的 SCD 症狀非常輕微,因此學者們就開始研究要怎麼讓 SCD 患者體內可以大讓生產 HbF。BCH 和 Dana-Farber 的研究團隊發現,成人紅血球內有大量的 BCL11A,當他們把 BCL11A 表現降低後,HbF 就會大量增加 [5]。

CASGEVY™ 的治療方式


2019 年十一月時,Dr. Charpentier 創立的瑞士的生技公司 CRISPR Therapeutics 和美國波士頓的 Vertex Pharmaceuticals 公佈了他們 CRISPR-Cas9 基因治療 CTX001 的第一、二期臨床試驗結果 [1-3]。這個試驗的兩位病患分別患有鐮刀型紅血球疾病(sickle cell disease, SCD)和乙型地中海貧血(transfusion-dependent β thalassemia, TBT),患有地中海貧血的病患在今年初開始接受治療,SCD 病患則在今年年中接受治療,而 CTX001 也在四月底時拿到用來治療 TBT 的 FDA Track Designation [4]。

CTX001 治療是把造血幹細胞(hematopoietic stem cells, HSPs)抽出來,用電擊(electroporation)把 CRISPR-Cas9 送進細胞裡,利用 CRISPR-Cas9 的編輯功能阻斷 BCL11A 的表現,使紅血球能夠生成 HbF,再把編輯過後的紅血球輸回病患體內 [1, 2]。2020 年年底,他們把追蹤一年後的臨床結果發表在 NEJM。他們先是抽了十位健康個體的 CD34+ HSPs 做基因編輯,看修正率和 off-target editing 有多少。分析後的結果是修正率有 80±6%,編輯過後 HSP 的 HbF 增加了 29.0±10.8%,沒編輯過的則是 10.5±5.2%,他們也沒發現有 off-target editing 的情況。TBT 患者在治療前每年需要接受多次輸血,而在接受治療九個月後便不再需要輸血。SCD 患者在治療前每年會發生多次 vaso-occlusive crises (VOCs),在治療後便不再出現 VOCs。兩位病患在治療後觀察一年的期間內,HbF 都持續穩定的增加,雖然治療中都出現不適的情況,不過診斷過後排除是治療造成的。研究中表示,之後有六位 TBT 和兩位 SCD 患者參與 CTX001 治療,在追蹤了至少三個月後,治療效果和前兩位患者一樣。不過,雖然所有患者在治療後 HbF 持續增加,不過有件令人擔憂的事。之後在 ASH 發表其中七位的病患資料中顯示,正常的成人版 Hb 似乎有下降的趨勢,HbF 和成人版 Hb 似乎會競爭 [6, 7]。

Vertex 於 2021 年四月宣布和將給 CRISPR Therapeutics $900M 在研發、量產和上市上,雙方同意在支出和營收上,Vertex 負擔 60% 的支出和在上市後拿 60% 的營收 [8, 9]。2023 年四月,Vertex 和 CRISPR Therapeutics 將藥物申請送 FDA 審核,此療法原本叫 CTX001,以 exa-cel 這個名稱送審,取之於 exagamglogene autotemcel。2023 年年底,FDA 核准該藥用於治療 SCD,以商品名 CASGEVY™ 上市,之後於 2024 年年初獲得核准用於治療 TBT。

另外要提的是 Vertex 的在治療 TBT 上有個競爭對手 bluebird bio,它的 Zynteglo 已在 2019 年六月於歐洲上市,但是尚未拿到美國 FDA 許可。2021 年二月的時候,公司決定停止銷售 Zynteglo,因為它的另一個用來治療 SCD 的基因治療 LentiGlobin 在第一、二期臨床試驗的中,有兩位患者分別得到急性血癌(acute myeloid leukemia, AML)和骨髓增生異常綜合症(myelodysplastic syndrome, MDS),而 Zynteglo 用的 lentiviral vector 和 LentiGlobin 是相同的 [10, 11]。Zynteglo 在美國的臨床試驗先前也遭到暫停,不過六月時 FDA 讓它恢復 TBT 第三期的臨床試驗,LentiGlobin 目前也在第一、二期臨床試驗中。雖然如此,要申請 FDA 審核也要延到 2022 年年底,因此 Vertex 的 CTX001 可能搶先一步 [12]。


Clinical trials:
NCT03745287 (CLIMB SCD-121) - A Safety and Efficacy Study Evaluating CTX001 in Subjects With Severe Sickle Cell Disease
NCT03655678 (CLIMB THAL-111) - A Safety and Efficacy Study Evaluating CTX001 in Subjects With Transfusion-Dependent β-Thalassemia



Articles:

1. Science | Company claims signs of success with CRISPR-edited stem cell transplants for two genetic diseases (Nov 2019)

2. The Scientist | Early Results Are Positive for Experimental CRISPR Therapies (Nov 2019)

3. VERTEX News | CRISPR Therapeutics and Vertex Announce Positive Safety and Efficacy Data From First Two Patients Treated With Investigational CRISPR/Cas9 Gene-Editing Therapy CTX001® for Severe Hemoglobinopathies

4. GlobeNewswire | CRISPR Therapeutics and Vertex Announce FDA Fast Track Designation for CTX001 for the Treatment of Beta Thalassemia (April 2019)

5. NIH Director's Blog / A CRISPR Approach to Treating Sickle Cell (April 2019)

6. FIERCE Biotech | CRISPR, Vertex show CRISPR/Cas9 gene-editing therapy works in more patients (Nov 2020)

7. 2020 ASH | 4 Safety and Efficacy of CTX001 in Patients with Transfusion-Dependent β-Thalassemia and Sickle Cell Disease: Early Results from the Climb THAL-111 and Climb SCD-121 Studies of Autologous CRISPR-CAS9–Modified CD34+ Hematopoietic Stem and Progenitor Cells

8. Vertex | Vertex Pharmaceuticals and CRISPR Therapeutics Amend Collaboration for Development, Manufacturing and Commercialization of CTX001™ in Sickle Cell Disease and Beta Thalassemia (April 2021)

9. GEN News | Vertex Pays $900M Upfront to Lead CTX001 Development with CRISPR Therapeutics (April 2021)

10. FIERCE biotech | Bluebird bio gets FDA green light to restart sickle cell gene therapy trials after rocky few months (June 2021)

11. FIERCE Pharma | Bluebird's Zynteglo trials set to resume, putting gene therapy back on flight path to FDA filing (June 2021)

12. FIERCE Pharma | Bluebird tanks as FDA's LentiGlobin demands in sickle cell delay filing to late 2022 (Nov 2020)

13. BioPharma Dive | Vertex, CRISPR finish US filing for gene editing drug approval (2023)




Papers:

NF Olivieri, The β-Thalassemias. NEJM (1999)

Vijay G Sankaran et al, Human Fetal Hemoglobin Expression Is Regulated by the Developmental Stage-Specific Repressor BCL11A. Science (2008)

H Frangoul et al, CRISPR-Cas9 Gene Editing for Sickle Cell Disease and β-Thalassemia. NEJM (2020)











2019年11月23日 星期六

是否可在哺乳動群中產生 gene-drive?

利用 CRISPR 造成 gene-drive 消滅散播病菌的蚊蟲,可行嗎?如果大家還有印象的話,之前有人提出利用 gene-drive 去消滅散播瘧疾的蚊蟲,但這個做法有爭議,因為這牽扯到整個物種的基因改變,是否會對生態造成影響還不知道。

三年前,UCSD 的 Gantz 和 Bier 先是研發了一個叫做 mutagenic chain reaction (MCR) 的技術,利用細胞本身的 HDR (homology-directed repair) 功能,可以有效的把生物基因體裡的一對基因都突變(homozygous mutations),使在兩個染色體上的此基因失能。這個技術主要是在一對基因的其中一個中插入了一個 Cas9-gRNA cassette 使其失能外,之後利用細胞本身的 HDR 把另一個基因也切斷並插入 Cas9-gRNA cassette,造成 homozygous mutation,使那一對基因整個失能(loss-of-function)。那要怎麼知道這個方法是否能夠有效的產生 homozygous mutation?假設果蠅本身的某對隱性基因中有一個帶有突變,也就是所謂的 heterozygous mutation,那這個突變並不會表現在外觀上(phenotype),但透過這個技術,可以有效地使果蠅轉換成一對基因的兩個都帶有突變,使這個突變表現在外觀上。並且,當這個帶有 Cas9-gRNA 的果蠅和野生果蠅交配後,產生的後代也會有 50% 的機會帶有 Cas9-gRNA cassette,使其出現 loss-of-function 的突變,隨之產生 gene-drive 的情況。

照理來說,這個技術應該可以應用在任何生物身上,不只有果蠅。於是,UCSD 的另一個團隊想在老鼠中嘗試 gene-drive,這樣就可以大量生產研究用的基改老鼠。他們讓母鼠帶有 Cas9,讓公鼠帶有 gRNA (guide RNA),交配後的後代小鼠就會帶有 Cas9 和 gRNA,並且會在不同的染色體上,因為從爸爸來的那個會帶有 gRNA,從媽媽來的則帶有 Cas9。不過這個實驗沒果蠅那麼成功,主要是在公鼠的部分,可能是因為精子會在進行 meiosis (減數分裂) 前現進行普通的 mitosis,而這時期 Cas9 造成的切口會用 NHEJ (non-homologous end joining) 來修復,而不是 HDR。另外就是 Cas8 和 gRNA 是在不同的染色體上,所以如果和野生鼠交配,就會缺少其中一個元素而無法進行突變。


Figure / S Khan et al, J Biomedical Science 2018 (doi: 10.1186/s12929-018-0425-5)


Articles:

Science / ‘Gene drive’ passes first test in mammals, speeding up inheritance in mice (July 2019)


Papers:

VM Gantz & E Bier, The mutagenic chain reaction: A method for converting heterozygous to homozygous mutations. Science (2015)

HA Grunwald et al, Super-Mendelian inheritance mediated by CRISPR/Cas9 in the female mouse germline. bioRxiv (2019)










2019年11月22日 星期五

狗的年齡新算法

要怎麼把狗的年紀換算成人類的年紀?

記得以前學到的是把狗的年齡乘以七,就是人類的年紀,例如狗的兩歲相當於人類的十四歲。不過呢,最近這一篇研究提供了一個新的算法,這個算法是由 DNA methylation 的程度衍化而來的。

UCSD 的基因學家 Trey Ideker 和他的同事們分析了一百多隻拉布拉多的 DNA methylation 的情況,從四週大到十六歲,發現人類和狗的 methylation 情況都和年齡相關,尤其在某些和發育(development)相關的基因上,DNA methlyation 的情況隨著老化而改變。當把年輕狗和年輕人或是老狗和老人的 methylation 相比較後,發現年輕狗和年輕人的 methylation 程度相似、老狗和老人的相似,而且也符合生理發展上的特徵,例如七週大的小狗和九個月大的嬰兒在 methylation 的程度上相似,而兩者在生理上也都處於正要長牙的階段。

他們由分析的結果得出了一個新的算式,這個算式符合了拉布拉多和人類的平均壽命:拉布拉多的十二歲和人類的七十歲。
canine’s human age = 16 ln(dog age) + 31

也就是狗的一歲,換成人的話就是 31 歲。
canine's human age = 16 * ln(1) + 31 = 16 * 0 + 31 = 31

Dog --> Human
1 --> 31
2 --> 42.1
3 --> 48.6
4 --> 53.2
5 --> 56.8
6 --> 59.7
7 --> 62.1
8 --> 64.3
9 --> 66.2
10 --> 67.8
11 --> 69.4
12 --> 70.8
13 --> 72
14 --> 73.2
15 --> 74.3

目前這個研究團隊有一個新的計劃 Dog Aging Project,是研究狗的老化,包括除了拉布拉多以外的品種,如果有養狗人士有興趣,可以和他們合作,把狗的口水寄給他們研究。



Article:
Science / Here’s a better way to convert dog years to human years, scientists say (Nov 2019)


Paper:
T Wang et al, Quantitative translation of dog-to-human aging by conserved remodeling of epigenetic networks. bioRxiv (2019)










2019年7月5日 星期五

預防病毒感染除了打疫苗外還有什麼方法?

上個月刊在 Science Immunology 的一篇研究用的方法是用 CRISPR 改造 B cells。抗體基因分成 heavy chain (IgH) 和 light chain (IgL) 兩個部分,兩個都需要幾過幾次的 splicing 去除掉不需要的 V(D)J regions 才會變成最終的一個抗體。他們在 IgH VDJ 和 C (constant) region 中間的 intronic region 插入了對抗某個病毒(在這個研究裡是 RSV 和 Influenza) 的抗體的 IgL 和 IgH VDJ 的部分,C 的部分用原有(endogenous)的基因以減少需要插入基因的長度,使得改造過的 B cells 可以生產他們想要的抗體。


Figure / Wikipedia - VDJ recombination

他們把改造過的 B cells 植入老鼠體內,然後再輸入後的一個禮拜後,再讓老鼠感染 RSV (respiratory syncytial virus),感染五天後取其肺臟和胰臟側病毒量,並且和抗體藥 palivizumab 的效果做比較,結果顯示效果和抗體藥一樣好。另外,改造過的 B cells 在老鼠體內可以維持多久也是個問題,所以他們也測試了長期的效果,他們在移植基改 B cells 後的 87 天後才讓老鼠感染 RSV,然後同樣在感染五天後測量胰臟和肺臟的病毒量,結果和移植七天後的效果是一樣的。

這個方法如果在人體內可行的話,或許可以取代很難研發的疫苗,不過目前的老鼠實驗只測到 87 天後的效果,是否可以維持年以上的效果還不知道。



Article:

Science / Genetically engineered immune cells fight off deadly virus in mice (May 2019)


Paper:

HF Moffett et al, B cells engineered to express pathogen-specific antibodies protect against infection. Science Immunology (2019)









2019年6月28日 星期五

第一型糖尿病患的新型免疫細胞

對免疫系統稍有了解的,大概都知道免疫 T 細胞(T cells)和 B 細胞(B cells),兩者的產地不同。T 細胞由胸腺(thymus)生產,又分為兩種,殺手 T 細胞(CTLs; cytotoxic T cells)和 helper T cells),主要是用來殺死外來物,例如病毒和細菌。B 細胞則是產於骨髓(bone marrow)和淋巴結(lymph nodes),功能是記住外來物的樣子,然後在相同外來物再度入侵時,可以生產抗體抵禦。

不過最近研究發現,第一型糖尿病患(Type I diabetes, T1D)有種特別的免疫細胞,是 B cell 和 T cell 的混合體,同時表現 TCR (T-cell receptors)和 BCR (B-cell receptors),例如大多數的 DE cells 會表現 IgD 和 IgM [註 1]。另外,他們也同時表現 B cell 和 T cell 獨有的基因,目前暫稱為 dual expresser (DE) cells。普通的健康個體也有 DE cells,但是 T1D 患者比較多。除此之外,他們的 BCR CDR3 帶有一段特別的 amino acid sequence,只有第一型糖尿病患者的 BCR 才有,健康個體的沒有。第一型糖尿病主要是因為 T cells 跑去殺死製造胰島素(insulin)的胰臟 β cells,使其無法生產胰島素。目前認為 T 細胞會殺死 β cells 是因為胰島素的一個氨基酸片段 B:9-23 (SHLVEALYLVCGERG) 被 HLA (human leukocyte antigen)呈現給惹 T cells [註 2],使它誤以為胰島素是入侵者需要被消滅,而表現胰島素的 HLA 則是 HLA-DQ8,一種大量出現在第一型糖尿病患裡的 HLA。B:9-23 片段對普通的 HLA-DQ8 的 affinity 是很低的,但是 T1D 患者的 DQ8 binding pocket 裡和胰島素接觸的兩個氨基酸(A14, R22)如果突變為 A14E 和 R22E 的話,affinity 會增加百倍以上。

註 1:BCR 簡單來說就是黏在 B cells 表面的抗體,所以也同樣有三個辨識抗原的 CDRs (complementarity-determining regions)。抗體有五種 -- IgA, IgD, IgE, IgG & IgM,BCRs 則主要為 IgD 和 IgM。

註 2:HLA 屬於 Class II MHC (MHCII),表現在 APC (antigen-presenting cells) 表面,有個 binding pocket 會結合抗原(antigen),然後把它呈現給 T cells,告訴 T cells 這是入侵物,快去殺死它。



作者們認為第一型糖尿病的 T 細胞會攻擊 β cells 是因為這段特別的氨基酸片段 DE peptide 可能會和 HLA-DQ8 結合,進而引發 T cells 的攻擊,他們用電腦模擬的結果發現 DE peptide 和 HLA-DQ8 的結合力非常強,比胰島素的片段還大到上萬倍,因此很可能引發強大的 T 細胞反應。而實際實驗結果也顯示 DE peptide 的確會和 HLA-DQ8 結合,並且會刺激第一型糖尿病患的 T helper cells 產生免疫反應,指示 CTLs 去攻擊胰臟的 β cells。不過,雖然目前看來第一型糖尿病患的 DE peptide 是引發 CTLs 去攻擊生產胰島素的 β cells 的原因,但是胰島素在這中間扮演了什麼角色呢?如果 HLA-DQ8 結合的目標物是 DE peptide,為什麼 CTLs 攻擊的會是 β cells 呢?目前原因還不清楚,需要更多的研究。



Article:

The Scientist / Novel Type of Immune Cell Discovered in Type 1 Diabetes Patients


Paper:

R Ahmed et al, A Public BCR Present in a Unique Dual-Receptor-Expressing Lymphocyte from Type 1 Diabetes Patients Encodes a Potent T Cell Autoantigen. Cell (2019)


Book: B Cells and Antibodies, Molecular Biology of the Cell (4th ed.)










哪個國家最誠實?

Science 前兩天刊了一個有趣的研究,是大規模的行為試驗:到底哪個國家的公民最誠實?

這個研究是在四十個國家的共 355 個主要城市裡的公家或私人機構丟包超過 17000 個(長得像透明片夾 business cards,因為要讓人可以不用打開就看到裡面有什麼的)錢包。丟包的地點包括有銀行、電影院、博物館、郵局和飯店等等,丟包的方式是研究人員走去櫃檯說,「不好意思,我剛剛撿到這個錢包,但是我趕時間,你能不能幫忙把錢包物歸原主?」然後看有多少人會跟失主聯絡。另外,錢包有兩種,一種是裡面只有聯絡方式但是沒錢的,另一種是裡面有 USD$13.45,他們想知道哪個國家的公民回報率最高,哪種錢包比較多人回報,有錢的還是沒錢的。


Figure / Cohn et al, Science (2019)

結果呢,撿到錢包後會回報的比例,四十個國家中,瑞士最高,加拿大中間(比美國高,意外嘛?XD),中國最後(不意外?),比中國好兩三名的是摩洛哥、肯亞、秘魯和馬來西亞。回報的時間則是瑞士人第一天就聯絡失主惹,美國和英國平均三個禮拜後才回報失主,中國則是四十天後。另外,有趣的是有裝錢的錢包的回報率比沒錢的高。

btw, 日本竟然沒在實驗國家裡,不知道它和瑞士比哪個比較誠實。😆

(其實我覺得這個研究的實驗方式比較像是測試服務態度和做事效率,因為有的人可能會覺得 "That's not my job",聯絡失主不在他的工作範圍內,有錢的回報率比較高是因為覺得失主會很著急,沒錢的話就覺得無所謂而懶得聯絡,反正也不是他的職責,做了也不會加薪。)


Paper:

A Cohn et al, Civic honesty around the globe. Science (2019)










2019年6月14日 星期五

鬧血荒怎麼辦?把血液全部變成 O 型血!

血型的不同在於它們表面帶有不同的抗原(antigen)和抗體,血型 A 型的紅血球表面帶有 Type A antigen 和抗體 anti-B,B 型的人帶有 Type B antigen 和抗體 anti-A,AB 型的則帶有 A, B 兩種抗原但是不帶有抗體,O 型的人則不帶有抗原,但是帶有 anti-A 和 anti-B 兩種抗體。


Figure / Blood Groups and Red Cell Antigens - Chapter 5 The ABO blood group

抗原和其對應的抗體相結合,例如抗原 Type A antigen 和抗體 anti-A 結合的話就會引發免疫反應造成溶血(hemolysis),所以不同血型的人不能互相輸血,但是 AB 型的人可以接受所有人的血,因為他不帶有抗體,而 O 型可以捐血給所有人,因為它不帶有 A, B antigens 。

如果血庫缺少某種血或需要某種血怎麼辦?要是可以把所有的血全部變成 O 型血就好了,這樣不管需要哪種血都可以輸 O 型血。

UBC 的研究團隊在這篇研究中,發現人類的腸道菌中有兩種酵素可以把紅血球上的 Type A antigen 移除使它變成 O 型。紅血球表面的抗原,其實就是不同的醣連結 (carbohydrate chains),A 型的比 O 型的多帶了個 GalNAc (N-acetylgalactosamine),B 型的則是多帶惹 galactose。

他們掃了上萬個腸道菌基因,發現腸道菌 Flavonifractor plautii 的兩個酵素 N-acetylgalactosamine deacetylase (GalNAc deacetylase) 和 α-galactosidases (GalNase),這兩個酵素合作的話,可以有效去除紅血球上的 Type A antigen,也就是把某部分的醣切掉,使它變成成 O 型紅血球上較短的醣連結。同理,也可以把 B 型紅血球表面的抗原去除,使它變成 O 型。


Figure / Blood Types and Carbohydrate Chemistry

UBC 團隊目前只試惹 A 型血,因為它比較普遍。不過,真的要用於輸血之前,要先有確認所有的 A 型紅血球都有被轉換成 O 型才行。


Article:

Science News / Type A blood converted to universal donor blood with help from bacterial enzymes (June 2019)


Paper:

P Rahfeld et al, An enzymatic pathway in the human gut microbiome that converts A to universal O type blood. Nature Microbiology (2019)