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2019年11月23日 星期六

是否可在哺乳動群中產生 gene-drive?

利用 CRISPR 造成 gene-drive 消滅散播病菌的蚊蟲,可行嗎?如果大家還有印象的話,之前有人提出利用 gene-drive 去消滅散播瘧疾的蚊蟲,但這個做法有爭議,因為這牽扯到整個物種的基因改變,是否會對生態造成影響還不知道。

三年前,UCSD 的 Gantz 和 Bier 先是研發了一個叫做 mutagenic chain reaction (MCR) 的技術,利用細胞本身的 HDR (homology-directed repair) 功能,可以有效的把生物基因體裡的一對基因都突變(homozygous mutations),使在兩個染色體上的此基因失能。這個技術主要是在一對基因的其中一個中插入了一個 Cas9-gRNA cassette 使其失能外,之後利用細胞本身的 HDR 把另一個基因也切斷並插入 Cas9-gRNA cassette,造成 homozygous mutation,使那一對基因整個失能(loss-of-function)。那要怎麼知道這個方法是否能夠有效的產生 homozygous mutation?假設果蠅本身的某對隱性基因中有一個帶有突變,也就是所謂的 heterozygous mutation,那這個突變並不會表現在外觀上(phenotype),但透過這個技術,可以有效地使果蠅轉換成一對基因的兩個都帶有突變,使這個突變表現在外觀上。並且,當這個帶有 Cas9-gRNA 的果蠅和野生果蠅交配後,產生的後代也會有 50% 的機會帶有 Cas9-gRNA cassette,使其出現 loss-of-function 的突變,隨之產生 gene-drive 的情況。

照理來說,這個技術應該可以應用在任何生物身上,不只有果蠅。於是,UCSD 的另一個團隊想在老鼠中嘗試 gene-drive,這樣就可以大量生產研究用的基改老鼠。他們讓母鼠帶有 Cas9,讓公鼠帶有 gRNA (guide RNA),交配後的後代小鼠就會帶有 Cas9 和 gRNA,並且會在不同的染色體上,因為從爸爸來的那個會帶有 gRNA,從媽媽來的則帶有 Cas9。不過這個實驗沒果蠅那麼成功,主要是在公鼠的部分,可能是因為精子會在進行 meiosis (減數分裂) 前現進行普通的 mitosis,而這時期 Cas9 造成的切口會用 NHEJ (non-homologous end joining) 來修復,而不是 HDR。另外就是 Cas8 和 gRNA 是在不同的染色體上,所以如果和野生鼠交配,就會缺少其中一個元素而無法進行突變。


Figure / S Khan et al, J Biomedical Science 2018 (doi: 10.1186/s12929-018-0425-5)


Articles:

Science / ‘Gene drive’ passes first test in mammals, speeding up inheritance in mice (July 2019)


Papers:

VM Gantz & E Bier, The mutagenic chain reaction: A method for converting heterozygous to homozygous mutations. Science (2015)

HA Grunwald et al, Super-Mendelian inheritance mediated by CRISPR/Cas9 in the female mouse germline. bioRxiv (2019)










2017年11月4日 星期六

蠶寶寶吐蜘蛛絲

這好酷,基改蠶寶寶讓它吐蜘蛛絲。因為蜘蛛絲比較有韌性,但又無法人造合成,加上蜘蛛和蠶寶寶不一樣,牠們是肉食性且有地盤性,會把地盤內的其他蜘蛛吃掉,因此無法養一堆大量生產,於是密西根的 Kraig Biocraft Laboratories (KBL) 就想到了讓蠶吐蜘蛛絲這個方法。他們用的品種是 Bombyx mori,為了確認蜘蛛的基因有成功嵌入進蠶的基因裡,他們加了 GFP 作為 marker,所以當你把蠶(蜘蛛)絲放在 UV light 下看,它還會散發綠綠的螢光,蠶蛹(cocoons)也會散發出綠色的光澤。 😍

KBL 目前有 20 種會吐蜘蛛絲的基改蠶株,他們最新的一種蠶絲叫 Dragon Silk,很輕、很有韌性,已和美軍簽下百萬元的訂單。

不過瑞典 Karolinska Institute 研究蠶的專家指出,蜘蛛絲和蠶絲不一樣,蜘蛛吐絲的目的並不是結蛹,所以絲本身不會黏在一起,蠶則是需要結蛹,所以會牠的絲裡有一種蛋白(sericin)能讓絲黏在一起。蜘蛛為了不讓絲結在一起,會在吐絲的同時調節它的 pH。雖說如此,我個人是覺得這不是大問題,其他人的嘗試還比較麻煩吧,例如讓基改羊讓羊奶含有大量的蜘蛛絲蛋白,或是基改 E. coli, 菸草、馬鈴薯或酵母讓它們生產絲蛋白,然後再自己轉成絲線。

ps. 結蛹的動詞是用 spin,結蛹就是 spin cocoons。



Articles:

U.S. Army Exercises Contract Option with Kraig Biocraft Laboratories awarding additional funding to Develop and Deliver Spider Silk Technology

The Scientist / Meet the Transgenic Silkworms That Are Spinning Out Spider Silk


Paper:

Biomimetic spinning of artificial spider silk from a chimeric minispidroin