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2024年6月1日 星期六

啤酒風味的秘密:AI 揭示哪些成分讓啤酒更好喝

隨著 AI 技術越來越進步,越來越平民化,可以應用的地方也越來越多,只要你有創意,任何地方都可以用 AI 幫你研發或賺錢,例如密西根大學的研究團隊想知道口腔益生菌需要哪些氨基酸,以便促進它們的生長,於是開發了一個人工智慧系統 BacterAI,用來預測益生菌喜歡什麼口味。

既然都可以用 AI 預設哪種口味比較瘦益生菌歡迎了,也可以用來預測人類的吧?例如哪種啤酒比較受歡迎?

比利時的啤酒研究中心


比利時的 KU Leuven (Katholieke Universiteit Leuven) 是世界前百大大學之一,除了大學本身外,還有好幾個研究中心,其中一個是專門研究啤酒的 Leuven Institute for Beer Research (LIBR),除了有釀造啤酒的設備外,也有提供各種釀造啤酒的課程,以及釀造諮詢的服務。除此之外,他們也和 VIB 合作成立一個 VIB-KU Leuven Center for Microbiology,這個中心比較偏重研發,以及把學術界研發出來的東西商業化。這個中心裡面主要有五個實驗室,其中的一間實驗室 Verstrepen Lab,主要是研究啤酒酵母 Saccharomyces cerevisiae。

分析啤酒的風味


實驗室主持人 Kevin J. Verstrepen 和其研究團隊近期有一篇發表在 Nature Communications 的研究,是利用 AI 來預測啤酒裡的什麼分子會讓啤酒更好喝、更受歡迎。

研究團隊找了市面上賣的 250 種比利時啤酒,依它們的風味分成 22 種,包括了拉格(Lager)/Pils、Porter/Stout、Hoppy、Brown、Christmas (聖誕節特殊風味) 和 Strong Ale 等等,以及八種低酒精或無酒精啤酒(ABV  ≤ 4.2%),其中 Blonds 和 Tripels 風味的啤酒佔大多數,分別為 12.4% and 11.2%,反映了他們在比利時市場的市佔率。他們分析了啤酒裡的化學成分。每啤酒都測量其 266 種化學性質,包括酒精濃度、酸鹼值、糖的濃度,以及超過 200 種啤酒風味的化學物質。

是什麼讓啤酒有不同的風味?


他們發現有超過三成(37.2%)的化學物質是由啤酒花而來的 terpenoids,主要為草本和果香的味道。第二多的是酵母代謝物,包括甘油(glycerol)、酯類(esters)和酒精,為果香。其餘的則為麥芽衍生物,或是其他非 Saccharomyces 的酵母或微生物。另外,如果化學物質來源是相同的話,它們的濃度也會呈正相關,例如 citronellol 和 alpha-terpineol 皆為來自啤酒花的香氣,彼此之間的相關性強度為中等,但和啤酒花的苦味分子 iso-alpha acids 則沒有相關性,也就是說釀酒者可以透過加入啤酒花的時間來調整其香氣和苦味,早加的話苦味較多香氣較少,因為香氣揮發掉了,晚加的話則苦味較少,但保留較多的香氣。

除此之外,不同風味的啤酒都有其獨特的風味化學分子組合,除了所有風味的啤酒都帶有發酵本身會產生的甘油、乙醇(ethanol)和酯類外,酸啤酒的酸來自乳酸和醋酸,是因為是用醋酸菌或乳酸菌釀造的,例如 West Flanders (愛爾啤酒) 和 Fruit。啤酒花釀的啤酒,其苦味則帶有柑橘類和熱帶水果的香氣,釀造者可透過啤酒花的選擇來調節苦味和香氣,通常也含有較少的乳酸(lactic acids)和醋酸(acetic acids)。酒精濃度較低或無酒精的啤酒,其甘油和酯類物質較少。

利用 AI 找出受歡迎的啤酒風味


他們同時也對超過 18 萬個客人評價進行感官分析,然後將這些化學成分與甜味、酸度和口感等感官方面相連,餵給 AI 模型進行訓練,再用模型預測哪些成分最後歡迎,把這些成分添加在原本的啤酒裡讓品酒師盲測,結果都覺得調味過的啤酒比原來的更濃郁、更好喝。

經過評比之後,發現的幾個讓啤酒更好喝的要素:

  • 乙酸乙酯(Ethyl acetate): 最關鍵因素,為啤酒帶來果香味和酒精味,但濃度影響很大,太濃可能反而不討喜。
  • 乙醇(Ethanol): 第二重要因素,會影響啤酒風味和其他揮發物質帶給人的感受。
  • 蛋白濃度:影響口感和啤酒整體風味,讓啤酒更濃郁,增加啤酒喜愛度。
  • 乳酸(Lactic acid): 酸啤酒的酸味來源,喜愛度滿高的。
  • Methanethiol & ethyl phenyl acetate: 對啤酒的風味意外的重要,雖然濃度高可能讓啤酒有種陳年的味道。



AI 技術在啤酒釀造領域的應用,為啤酒產業的發展帶來了新的機遇。未來,AI 將在啤酒釀造中發揮更加重要的作用,也許大家將來可以調出自己喜歡的啤酒風味,或是請 AI 配出你想要的啤酒風味。



Articles:

Science | Can brewers use AI to make better beer?


Reference:

M Schreurs, S Piampongsant, M Roncoroni et al. Predicting and improving complex beer flavor through machine learning. Nat Commun (2024) DOI: 10.1038/s41467-024-46346-0










2020年11月20日 星期五

用基改益生菌治療 C. difficle 感染

之前有介紹過,量產抗體有幾個選項,可以用動物細胞,可以用大腸桿菌,也可以用酵母,另外還有一種是雞蛋(IgY)。

相關文章:關於抗體和抗體藥的一些小知識

這篇研究用的是酵母菌,把基改後可以生產抗體的酵母菌吃下去,讓它在體內製造抗體來對抗 Clostridioides difficile (困難梭狀桿菌)感染。困難梭狀桿菌感染(Clostridioides difficile infection, CDI)通常發生在老年人,尤其是有在服用治療其他感染的抗生素的,抗生素會殺掉很多細菌,包括好的腸道菌,使它們無法對抗 C. difficile,雖然針對 C. difficile 的抗生素大多有效,但有時候會反覆感染,最後造成死亡。

 
Figure / Clostridioides difficile Infection (US CDC)

除了用抗生素治療,另一種就抗體治療,普通的做法是大量生產、純化抗體後,然後靜脈注射至血管內,經由血液進到腸胃道,中和困難梭狀桿菌產生的毒素。這篇研究的團隊,想說與其要經過層層運輸,不如基改益生菌,讓它可以生產抗體,吃下去後直接進入腸胃道,不是更方便?而且如果可以讓益生菌(probiotics)在體內生產抗體,還省掉了純化抗體需要的時間和金錢。

目前用來生產抗體的酵母菌以 Saccharomyces 和 Pichia 為主,Saccharomyces 是 baker's yeast,Pichia 則是 brewer's yeast,比較常用來大量生產蛋白。S. cerevisiae 可能大家比較常用,通常做 yeast 2-hybrid 就是用這株,這篇研究用的是 Saccharomyce boulardii。關於 S. boulardii 的研究不多,不過它和 S. cerevisiae 是同種,照理說基改後應該也可以生產抗體,中和困難梭狀桿菌的毒素 TcdA, TcdB。

這篇研究用來中和 TcdA, TcdB 的是小抗體 VHH,他們把四個可以中和 TcdA, TcdB 的 VHH 接在一起,之間用 GSSS linker 接在一起成為 ABAB,然後測試它們的中和效力,並且和 Merck 的抗體藥 actoxumab & bezlotoxumab 相比,老鼠實驗(腹腔注射)的結果顯示,效果比 Merck 的抗體藥好一千倍,接下來要解決的就是怎麼把 VHH 用非注射的方式送到腸胃道。研究團隊選擇用益生菌,在益生菌中選擇用 S. boulardii,原因有幾個:安全性已知道,也有治療 CDI 的基本效用,並可和抗生素一起使用。雖然沒有用 S. boulardii 表現抗體的研究,但同種的 S. cerevisiae 已被廣泛用來表現抗體。他們先試著在 S. cerevisiae 裡表現 ABAB,看用哪個 secretion signal 表現最好,然後在放到 S. boulardii,經過一些 optimization 之後,表現量可以增加四倍,然後測試 S. boulardii 生產的 ABAB 是否仍具有中和效用,細胞實驗的結果顯示是可以的,再來就是測試安全性了。

相關文章:Phage display 和小抗體製造

他們讓接受抗生素的老鼠每天吃一劑的 S. boulardii (10^9 CFU),看看是否有副作用,結果顯示老鼠除了變胖之外,沒有明顯的副作用。除此之外,老鼠的糞便中還可測到持續表現 ABAB 的益生菌,重要的是從腸胃道取出的 gut fluid 仍保有抑制 TcdB-induced toxicity 的效用,沒有被餵食基改益生菌的老鼠糞便則沒有抑制 toxicity 的效用。

通常在治療細菌感染或是術前準備時,會給病患吃抗生素,但服用抗生素會增加 CDI 的感染風險,那表現 ABAB 的益生菌可以解決這個困擾嗎?在預防性治療實驗中,他們讓接受抗生素的老鼠先吃七天表現 ABAB 的基改益生菌,或是沒表現 ABAB 的益生菌,然後再讓他們感染 C. difficle,結果發現沒吃益生菌或是吃沒表現 ABAB 益生菌的老鼠出現CDI 感染症狀,糞便裡有 C. difficle 和其毒素,而吃表現 ABAB 益生菌的老鼠則症狀輕微或是無症狀,糞便裡的 C. difficle 也相對少。用在急性感染治療上的效果如何呢?老鼠在感染後八到十二個小時內出現症狀,有的在 48 小時內死亡,存活率大概五成,而被餵食表現 ABAB 基改益生菌的老鼠存活率有八成,而且復原力也較高。

在臨床上,病患在停止抗生素治療後,有時會出現反覆感染的狀況。在預防反覆感染的實驗中,老鼠在接受感染的一天後開始每天吃基改益生菌,連吃十三天。沒接受表現 ABAB 益生菌或沒表現 ABAB 益生菌的老鼠在停止 vancomycin 後出現再度感染的情況,像是腹瀉、體重減輕或死亡,而服用表現 ABAB 益生菌的老鼠再度感染的狀況顯著降低,只有輕微腹瀉,也沒有體重降低的狀況。

好好奇糞便裡的基改益生菌是否仍有抑制 toxicity 的效用。哦,對了,反基改人士會不會說他們寧願吃抗生素,也不要吃基改益生菌呢?XD



Articles:

US CDC: Nearly half a million Americans suffered from Clostridium difficile infections in a single year

Science / Antibody-producing yeast vanquishes deadly gut infection in mice (Oct 2020)


Paper:

K Chen et al, A probiotic yeast-based immunotherapy against Clostridioides difficile infection. Science Translational Medicine (2020)