狗的年齡新算法

要怎麼把狗的年紀換算成人類的年紀？

記得以前學到的是把狗的年齡乘以七，就是人類的年紀，例如狗的兩歲相當於人類的十四歲。不過呢，最近這一篇研究提供了一個新的算法，這個算法是由 DNA methylation 的程度衍化而來的。

UCSD 的基因學家 Trey Ideker 和他的同事們分析了一百多隻拉布拉多的 DNA methylation 的情況，從四週大到十六歲，發現人類和狗的 methylation 情況都和年齡相關，尤其在某些和發育(development)相關的基因上，DNA methlyation 的情況隨著老化而改變。當把年輕狗和年輕人或是老狗和老人的 methylation 相比較後，發現年輕狗和年輕人的 methylation 程度相似、老狗和老人的相似，而且也符合生理發展上的特徵，例如七週大的小狗和九個月大的嬰兒在 methylation 的程度上相似，而兩者在生理上也都處於正要長牙的階段。

他們由分析的結果得出了一個新的算式，這個算式符合了拉布拉多和人類的平均壽命：拉布拉多的十二歲和人類的七十歲。
canine’s human age = 16 ln(dog age) + 31

也就是狗的一歲，換成人的話就是 31 歲。
canine's human age = 16 * ln(1) + 31 = 16 * 0 + 31 = 31

Dog --> Human
1 --> 31
2 --> 42.1
3 --> 48.6
4 --> 53.2
5 --> 56.8
6 --> 59.7
7 --> 62.1
8 --> 64.3
9 --> 66.2
10 --> 67.8
11 --> 69.4
12 --> 70.8
13 --> 72
14 --> 73.2
15 --> 74.3

目前這個研究團隊有一個新的計劃 Dog Aging Project，是研究狗的老化，包括除了拉布拉多以外的品種，如果有養狗人士有興趣，可以和他們合作，把狗的口水寄給他們研究。



Article:
Science / Here’s a better way to convert dog years to human years, scientists say (Nov 2019)


Paper:
T Wang et al, Quantitative translation of dog-to-human aging by conserved remodeling of epigenetic networks. bioRxiv (2019)

有易胖體質的拉布拉多

原來拉布拉多有易胖體質啊，不知道還有哪種狗也有易胖體質。

拉布拉多容易胖是因為牠的 POMC gene mutation，此研究團隊找了 310 隻拉布拉多做定序，三個跟肥胖有關的基因（MG4R, AGRP, POMC），發現 POMC variations 中的 14bp deletion 和胖瘦有關，這個 14bp deletion 會造成 beta-MSH (melanocyte-stimulating hormone) 和 beta-endorphin 無法表現，也會影響體重和增加食慾，目前所知 beta-MSH 是負責控制食慾和肥胖的。此篇研究中的拉布拉多裡，10/15 胖狗和 2/18 瘦狗有這個 deletion，而這個 deletion 也只在品種相近的憑毛尋獵犬(flat-coat retriever)的基因中出現，其他品種包括米格魯、德國獵犬等等的則沒有。

有趣的是研究的 310 隻拉布拉多中包括了寵物犬和協助犬(assistance dog)兩種，但是 POMC deletion 出現在協助犬的比例較高，可能是因為訓練時需要用食物引導，所以帶有 POMC deletion 的狗比較容易被挑選來訓練成協助犬吧。（愛吃的狗比較好操控？XD）

註：拉布拉多和平毛獵犬是從十九世紀的 St. John’s water dog (聖約翰水獵犬)分出來的，現在這個品種已經絕跡。



Article:

B Panko, Why is my dog fat? Gene deletion may provide clues. Science (2016)


Paper:

E Faffan et al, A Deletion in the Canine POMC Gene Is Associated with Weight and Appetite in Obesity-Prone Labrador Retriever Dogs. Cell Metabolism (2016)